TTP LOQ Paper, As Told in Figures

Suzanne Dufault

Figure 1. Observed time-to-positivity trajectories

Observed TTP trajectories, where anything at or above 42 receives a value of 42.

Categorized TTP by Study

REMoxTB
ttp n prop
[0,25) 10759 0.7302
[25,42) 520 0.0353
[42,45) 3455 0.2345
MAMS-TB
ttp n prop
[0,25) 2164 0.6999
[25,42) 218 0.0705
[42,45) 710 0.2296
NC-002
ttp n prop
[0,25) 2597 0.854
[25,42) 140 0.046
[42,45) 304 0.100
NC-005
ttp n prop
[0,25) 2850 0.7795
[25,42) 174 0.0476
[42,45) 632 0.1729
NC-006
ttp n prop
[0,25) 3408 0.7448
[25,42) 362 0.0791
[42,60) 806 0.1761
Study 29
ttp n prop
[0,25) 1529 0.5945
[25,42) 136 0.0529
[42,60) 906 0.3523
NA 1 0.0004
Study 29X
ttp n prop
[0,25) 961 0.5321
[25,42) 128 0.0709
[42,60) 717 0.3970

Figure 2. Alluvial Plots

Figure 3. Signal-to-Noise

<environment: R_GlobalEnv>

Overall correlation within replicates: 0.7724

Figure 4. Posterior distributions for relative comparisons

Model Results

(REMoxTB) Posterior group-level estimates of slope from the 30- and 42-day models.
Estimate CI.l CI.u CI width Point Estimation CI Estimation
LOQ = 42
1. 2EHRZ/4HR.weeks 0.095 0.090 0.100 0.010 mode hdi
2. 2MHRZ/2MHR.weeks 0.104 0.100 0.109 0.009 mode hdi
3. 2EMRZ/2MR.weeks 0.107 0.102 0.111 0.009 mode hdi
LOQ = 30
1. 2EHRZ/4HR.weeks 0.089 0.085 0.093 0.008 mode hdi
2. 2MHRZ/2MHR.weeks 0.097 0.094 0.102 0.008 mode hdi
3. 2EMRZ/2MR.weeks 0.099 0.095 0.103 0.008 mode hdi
LOQ = 25
1. 2EHRZ/4HR.weeks 0.086 0.082 0.090 0.008 mode hdi
2. 2MHRZ/2MHR.weeks 0.095 0.091 0.099 0.008 mode hdi
3. 2EMRZ/2MR.weeks 0.097 0.093 0.100 0.007 mode hdi